VI Escola de Física Jayme Tiomno



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Simulações Computacionais de Sistemas Moleculares

Ministrante: Profa. Dra. Kaline Coutinho (DFGE-IFUSP)

Slideshows: Aula 1, Aula 2, Aula 3, Aula 4, Aula 5.

Este curso foi preparado com base numa disciplina de pós-graduação que tem 20 aulas gravadas e disponibilizadas no e-aulas da USP. Essas aulas gravadas podem ser acessadas aqui.

Formato: Presencial.

Horário: 13 às 15h.

Dias: 08 a 12 de agosto.

Carga Horária Total: 10h

Descrição: Neste minicurso serão apresentadas as técnicas tradicionais de simulação de sistemas moleculares (Dinâmica Molecular e Monte Carlo), os conceitos fundamentais de mecânica clássica e estatística e procedimentos de análise de resultados.

Sistemas moleculares, ou macromoleculares, densos e desordenados são tratados, hoje, de forma teórica e realista através das modernas técnicas de simulação computacional, que são de grande aplicabilidade nas áreas de Biofísica, Nanociência, Física de Materiais, Físico-química de soluções, Modelagem Molecular, ou em muitas áreas inter e multidisciplinares que envolvem Biologia, Química e Física. Entretanto, o conteúdo proposto neste minicurso não está contemplado de forma sistemática e aprofundada em nenhuma outra disciplina de graduação do IFUSP.

Pré-requisitos: Mecânica Clássica, Mecânica Estatística, e Física Quântica ou Física V ou Estrutura da Matéria.

Programa do curso:

  • Aula 1. Fases da matéria e suas propriedades principais para modelagem.

  • Aula 2. Modelo para o potencial de interação intra e intermolecular

  • Aula 3. Mecânica estatística de líquidos.

  • Aula 4. Método de Dinâmica Molecular.

  • Aula 5. Método Monte Carlo.

Bibliografia:

  • Computer Simulation of Liquids, M.P. Allen and D.J. Tildesley.

  • Understanding Molecular Simulation, From Algorithms to Applications, D. Frenkel and B. Smit

  • Molecular Modeling and Simulatio: An Interdisciplinary Code, T. Sclick

  • The Art of Molecular Dynamics Simulation, D. C. Rapaport

  • Métodos de Química Teórica e Modelagem Molecular, N. H. Morgon e K. Coutinho (Eds)